根据相关的规定，计算机软件著作权纠纷处理的方式是可以向登记中心提出异议，也可以法院进行起诉处理，还可以由双方当事人自行协商调解处理。着作权是受到法律保护的，任何人不能够进行侵权。
一、计算机软件的纠纷怎么处理
如果登记的时候发现计算机软件著作权被侵害的，可以向登记中心提出异议，也可以向人院起诉。
权利人的计算机软件著作权被侵犯时，可以根据情况要求侵权人承担相应的民事责任。
有下列侵权行为，又不构成犯罪的，应当根据情况，承担停止侵害、消除影响、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任：
(一)未经软件著作权人许可，发表或者登记其软件的;
(二)将他人软件作为自己的软件发表或者登记的;
(三)未经合作者许可，将与他人合作开发的软件作为自己单独完成的软件发表或者登记的;
(四)在他人软件上署名或者更改他人软件上的署名的;
(五)未经软件著作权人许可，修改、翻译其软件的;
(六)其他侵犯软件著作权的行为。
二、侵犯软件著作权的法律责任有哪些
应当根据情况，承担停止侵害、消除影响、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任;同时损害公共利益的，可以由著作权行政管理部门责令停止侵权行为，没收违法所得，没收、销毁侵权复制品，并可处以罚款;情节严重的，著作权行政管理部门还可以没收主要用于制作侵权复制品的材料、工具、设备等;构成犯罪的，依法追究刑事责任。
侵犯著作权或者与著作权有关的权利的，侵权人应当按照权利人的实际损失给予赔偿;实际损失难以计算的，可以按照侵权人的违法所得给予赔偿。赔偿数额还应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。
权利人的实际损失或者侵权人的违法所得不能确定的，由人民法院根据侵权行为的情节，判决给予五十万元以下的赔偿。
相关的法律规定如果有著作权侵权的行为，那么是需要承担相应的法律责任的，一般来说如果不构成犯罪的话，那么只需要承担民事责任和主要的方式是停止侵害的行为，赔偿损失，并且需要消除影响以及赔礼道歉，构成犯罪的追究刑事责任。
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