住院期间进行核磁共振检查，医保是否可以报销，取决于当地的医保政策，以下情况医保是可以报销的：

1、符合医保目录内的检查项目：核磁共振检查属于医保目录内的项目，但是需要注意的是，不同地区的医保目录可能会有所不同。

2、经医生诊断需要进行的检查：如果医生认为患者需要进行核磁共振检查来明确诊断或治疗疾病，那么医保是可以报销的。

3、在定点医疗机构进行检查：患者需要在当地的医保定点医疗机构进行检查，否则医保可能不予报销。

需要注意的是，医保报销的比例和金额也会因地区和医保政策的不同而有所差异，如果患者购买了商业保险，也可以咨询保险公司是否可以对核磁共振检查进行报销。

建议参考：

1、在住院前，患者可以咨询医生或医院的医保窗口，了解当地的医保政策和报销范围。

2、患者可以保留好所有的检查报告和发票，以便在报销时使用。

3、如果患者对医保报销有疑问，可以向当地的医保部门或相关机构咨询。

相关法条：

《中华人民共和国社会保险法》第二十八条规定：符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

《中华人民共和国社会保险法》第二十九条规定：参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算，社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。

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