三个月宝宝睡觉摇头可能是正常的生理现象，也可能与维生素D缺乏性佝偻病、中耳炎等疾病有关。
三个月宝宝睡觉摇头可能是正常的生理现象，也可能与疾病有关，需要具体情况具体分析。
正常的生理现象：
神经系统发育不完善：三个月的宝宝神经系统还没有发育完善，大脑皮层兴奋性较低，在睡眠时可能会出现不自主的摇头动作。
前庭功能发育不完善：宝宝在出生后的前几个月，内耳中的前庭器官还没有完全发育成熟，对头部位置的变化较为敏感，可能会通过摇头来感受外界的刺激。
皮肤瘙痒：如果宝宝头部出汗较多，或者接触了过敏原，导致皮肤瘙痒，也可能会通过摇头来缓解不适。
疾病因素：
维生素D缺乏性佝偻病：维生素D缺乏会导致宝宝血钙降低，神经兴奋性增加，出现多汗、摇头、烦躁、睡眠不安等症状。
中耳炎：如果宝宝患有中耳炎，会出现耳部疼痛、瘙痒等症状，也可能会通过摇头来缓解不适。
其他：湿疹、外耳道炎等疾病也可能导致宝宝睡觉摇头。
如果宝宝除了睡觉摇头外，还伴有其他异常症状，如多汗、烦躁、哭闹、夜惊、方颅、鸡胸等，应及时带宝宝到医院就诊，明确原因。
需要注意的是，宝宝的睡眠环境应保持安静、舒适，避免过度刺激。同时，要及时给宝宝补充维生素D，多晒太阳，促进钙的吸收。如果宝宝出现皮肤瘙痒等症状，要及时清理汗液，保持皮肤清洁干燥。如果宝宝有中耳炎等疾病，应及时就医治疗。
