月经干净后小腹隐痛可能是排卵性腹痛、痛经、妇科炎症、子宫内膜异位症、肿瘤等原因引起，持续时间较长、程度较重或伴有其他症状应及时就医。
月经干净后小腹隐痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和建议：
1.排卵性腹痛：为排卵后卵泡液对腹膜的刺激所致，一般腹痛都比较轻微，呈钝痛、隐痛或坠胀样疼痛，常常发生在一侧的下腹部，持续时间较短，为数小时至1-2天，可伴有肛门坠胀感。这种腹痛多无任何病理改变，妇科检查也完全正常，属于生理性腹痛，一般不需要处理。
2.痛经：分原发性与继发性痛经两种。原发性痛经常见于青春期少女，原因不清楚。随着年龄增长或结婚与生育后，一般可以自愈。继发性痛经常见原因为子宫内膜异位症及子宫腺肌症。表现为疼痛逐渐加重，多呈周期性发作，或非经期下腹有隐痛而行经前后加重。此外，常伴有不孕及月经失调，往往需要药物治疗。
3.妇科炎症：如盆腔炎、附件炎、子宫内膜炎等，多发生于育龄女性，疼痛在一侧或两侧，同时伴有白带增多。慢性者往往呈现出隐痛、腰酸痛或有坠胀感；急性者往往表现为腹痛拒按，并伴有发烧。
4.子宫内膜异位症：痛经是子宫内膜异位症的主要症状之一，多呈继发性和渐进性加重，还伴有性交痛、月经失调、不孕等。
5.肿瘤：如子宫肌瘤、卵巢肿瘤等，会引起月经干净后小腹隐痛，多为良性，但也有恶变的可能。如果肿瘤较大，还可能出现腹胀、便秘、尿频等症状。
如果月经干净后小腹隐痛持续时间较长、程度较重、伴有其他症状，或疼痛逐渐加重，应及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、性激素六项等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
此外，需要注意的是，一些妇科疾病在月经期间可能会加重，如子宫内膜异位症、盆腔炎等。因此，在月经期间应注意保暖，避免过度劳累和剧烈运动，保持心情舒畅，注意个人卫生，预防感染。如果出现月经异常、腹痛等症状，应及时就医。
总之，月经干净后小腹隐痛可能是正常的生理现象，也可能是某些疾病的表现。如果疼痛持续时间较长、程度较重或伴有其他异常症状，应及时就医，以便早期诊断和治疗。
